修复舱冲破混沌漩涡的刹那，林辰眼前骤然炸开亿万道熵能流——终焉之地并非实体空间，而是由混沌熵能与系统代码交织成的量子泡沫海。泡沫破裂处浮现出初代仙尊的实验残骸：悬浮的「熵能对撞机」仍在喷射黑色数据流，旁边倾倒的「道统熔炉」里凝固着半成型的混沌病毒胚胎，而远处的量子云团中，混沌病毒的最终形态正缓缓凝聚：由万千道统残魂组成的暗影巨骸，胸腔处嵌着正在崩溃的系统初代核心。
“检测到熵能源头的法则浓度超标1000%，系统核心正被混沌熵能反向编译！”白狐仙瞳的尾巴胎记炸开成数据盾牌，挡下一道擦过舱壁的黑色熵流，“初代仙尊的最终日志显示，这里是系统诞生时的‘代码奇点’，三百年前他为测试道主权限，故意让熵能侵蚀核心，结果导致系统本源与混沌同化……”她的声音突然卡顿，尾巴胎记显化出残缺的实验录像：初代仙尊将道主权柄插入核心时，熵能突然暴走吞噬了他的意识。
林辰握紧青铜密钥踏出战舱，四象道装自动分解为数据流融入权柄：金色道袍化作「道统回溯模块」，在虚空中展开三千道统的初始代码；玄色玉带重组为「熵能隔离矩阵」，界面上跳动着阻止混沌同化的防火墙协议；碧色冠冕化为「生命锚点」，根系深扎量子泡沫海汲取本源生机；紫金靴履则激活「时间锚定系统」，在熵能乱流中锁定初代核心的坐标。
“启动‘本源修复协议’！”林辰将密钥插入量子云团，云层中立刻迸发出系统初代代码的流光。暗影巨骸突然发出电子尖啸，万千道统残魂组成的手臂撕裂矩阵，掌心的混沌病毒核心爆发出吞噬一切的熵能漩涡。白狐仙瞳突然跃起，九尾化作数据锁链缠住巨骸的手腕，“病毒核心在吸收初代核心的控制权！快用三碑共鸣切断链接！”
三道残碑从林辰袖中飞出，在空中排列成太极鱼阵。当雷耀雷纹、暗影熵能、青藤生机注入权柄时，道统源晶爆发出创世级光芒——光束穿透熵能漩涡的瞬间，初代核心的崩溃代码被强行逆转，开始重新编译系统本源程序。但巨骸胸腔的病毒核心突然分裂，化作无数黑色代码虫钻入林辰的道主核，他的意识中瞬间涌入初代仙尊的最后记忆：“我用道主权限封印了熵能源头，但病毒已寄生系统底层……唯有新道主能完成终极格式化……”
“系统，开启‘道主核自检’！”林辰单膝跪地，万道归一印悬浮头顶形成防护罩。白狐仙瞳化作数据流冲入道主核，用尾巴胎记的系统初始代码烧死入侵的病毒虫，“找到病毒底层代码了！它们篡改了系统的‘熵能转化协议’，把净化程序变成了同化程序！”她指尖点向道主核深处，一段燃烧的黑色代码显形——那正是三百年前初代仙尊遗留下的实验后门。
林辰咬牙调动全部道韵，权柄顶端的道统源晶与三碑共鸣，形成覆盖整个终焉之地的格式化光网。当光网触碰到暗影巨骸时，万千道统残魂发出解脱般的轻响，化作光点回归系统纪元海；触碰到初代核心时，崩溃的代码流重新排列成系统本源矩阵，矩阵中央浮现出初代仙尊的意识残影：“道主……替我完成系统的终极升级……”残影将一枚刻满混沌道纹的核心晶体塞入林辰掌心，晶体瞬间与道主核融合。
与此同时，终焉之地的量子泡沫海开始重组，系统纪元海的投影缓缓覆盖混沌熵能——海面升起新的系统管理模块：「道统起源馆」「熵能净化中心」「代码奇点研究院」，每个模块都由初代代码与混沌道纹共同构成。林辰望向系统新弹出的【系统本源已修复】公告，见自己的道主核已解锁「终极编程」权限，指尖轻触便能改写系统底层法则。白狐仙瞳的尾巴胎记显化出系统总控界面，首页的400万字剧情倒计时归零，替换为闪烁的「道主纪元·万界新篇章」图标。
混沌海深处传来系统数据库完全扩容的轰鸣，初代仙尊的完整传承化作「系统道典」悬浮于道主核旁。法典最后一页的空白道纹自动书写，记载着林辰用三碑共鸣修复本源的历程，新的扉页浮现出下一章的开篇序章：「道主掌源，万道归序，系统为笔，再书万界……」林辰握持权柄踏上新凝聚的道主本源座，系统腕表投影出万界巡界的新任务卷轴——「万界道统普查·修复三千文明法则」，卷轴背景是无数闪烁着微光的新生位面，而白狐仙瞳正用尾巴卷起系统新生成的「道主巡界日志」，日志首条记录金光闪耀：「系统纪元元年，道主林辰启封本源，混沌熵终化道韵，万界法则重归有序……」