亲,欢迎光临小说旗!
错缺断章、加书:站内短信
后台有人,会尽快回复!
小说旗 > 都市言情 > 脑变 > 第636章 转专业
  • 主题模式:

  • 字体大小:

    -

    18

    +
  • 恢复默认

加州理工学院的新超算‘海狸’运行最初的酵母菌模拟程序,只需要十分钟,而原先的超算需要将近一百个小时。

不再是单纯的比拼算力,而是基因一号芯片配合曾凡专门设计的系统架构,能更好的适应模拟程序的运行。

新完成的果蝇模拟程序,超算第一次运行仍然消耗了十多个小时,这是一雌一雄同时模拟的完整过程,有了第一次的数据,后续模拟消耗时间会大幅度减少,这就是新超算系统的独特优势。

果蝇的细胞总数只有几十万,小白鼠的细胞总数一点五万亿以上,不过有了前面的数据积累,还有新型超级计算机的助力,模拟的难度没有细胞数目的差距那么大。

曾凡的实验计划是一年完成整个过程,小白鼠是哺乳动物,成长没有果蝇的变态过程,基因功能演化模拟的主要难度在胚胎发育阶段,只要这个起始阶段过去,后续难度会降低很多,可能都用不了一年时间。

为了配合曾凡的这个计划,帕米拉实验室的人员扩充到了八十多人,整个生物学部将近一半的人员都参与进来,如果人数不足,还可以随时找其他学校一起联合研究。

小白鼠和人类的基因组相似度超过百分之九十,如果能用超算成功模拟小白鼠,那距离模拟人类基因组的演化只有一步之遥,那意味着什么,很多人都清楚,学校内外有无数人都在默默关注着曾凡的模拟进程。

模拟从一颗受精卵细胞开始,雌鼠和雄鼠的染色体结合到一起,新的生命诞生,开始细胞的分裂过程。

别看果蝇到小白鼠基因的数目只从一万三增加到三万多,可是果蝇只有四对染色体,小白鼠却有二十对染色体,果蝇基因组碱基对一点四亿,小白鼠却有二十七亿,信息含量完全不是一个数量级。

碱基序列增加可不仅仅是模拟的复杂度提升,而是计算机模拟基因序列解螺旋和复制,RNA翻译的拼接肽链时间会更长,也更容易出错。

实际生命的诞生过程中同样会出错,有的错误不影响全局,可以忽略过去,有的错误可能导致整个基因复制中断,那就意味着失败,生命还没诞生就结束了。

越是开始阶段,这个过程当然越重要,受精卵第一次分裂在超算上面的演化模拟进行了整整一天的时间,不知道中断了多少次,曾凡不断修改数据,直到晚上十二点过才离开实验室回去睡觉,次日早早的又来到实验室。

超算并没有因为错误自动中止,演化模拟依然在持续进行,细胞分裂已经进行了上百次,已经从一个细胞变成了一个小肉团。

检查了一遍后台的数据,一切正常,并没有中断的记录,比果蝇演化刚开始的时候顺利了很多。

然后又检查分裂出来的细胞中的基因序列,看看有没有太多的错误,基因解螺旋复制再拼接组合的过程肯定会有错误,只要错误不影响后续发育就行,这部分模拟程序自身也会进行检查,小错误会自动修正,错误太大同样会自动中止。

相比较原先的超算,海狸自动修正功能更加优秀,这也是第一次分裂完成后,后续进展这么顺利的根本原因。

通过之前酵母菌,果蝇的模拟积累的数据,关于基因的复制转录,翻译到蛋白质的过程已经有了足够多的精确信息,这些信息总结出来的基本规律都是一样的,包括现在的小白鼠,微观上的演化过程都一样,区别的只是复杂程度。

就像木工的榫卯结构,基本原理和手法都相同,酵母菌是做了一个鲁班锁玩具,果蝇就相当于做了一套家具,小白鼠就相当于要做出一套纯木结构建筑。

基因组就相当于建造图纸,计算机演化模拟就是复现整个建造过程,前面的酵母菌和果蝇的模拟已经锻炼出来建筑技术,可以完成大部分小白鼠的演化模拟,但是这个工程毕竟更大,还涉及到更高深的建筑手段,肯定需要在不断试错中完成。

好在计算机的优点就是可重复性强,所有的数据都可以有序存储起来,相同的错误解决后下次不会再犯,模拟的过程也是在这样的过程中一点点进展。

每日重复的工作中,时间快速流逝,转眼间又临近春季学期期末。

实验室中与演化模拟同步孕育的小白鼠已经出生并且长大,繁殖出了后代,它们的后代都快到繁殖期了,超算中模拟的小白鼠还在孕育期没有出生。

与曾凡几个月专注于小白鼠的演化模拟中不同,薛燕这个学期忙碌了许多,不仅要顾及自己的学业,周末还要去贝拉农场,参与贝拉农场实验室的超算演化模拟。

单纯的操作超算除了开始的阶段,后续其实她不参与也没有关系,酵母菌和噬菌体的模拟程序已经很成熟,实验室的很多人都可以独立操作。

薛燕是真正的对这些微生物的改造产生了兴趣,看着这些现实中没有的微生物被设计出来,通过实验室合成制造出来,再作用于那些致病细菌身上,让她产生了莫名的成就感,尽管她只是配合别人工作,也让她对这些研究产生了浓厚兴趣。

她的本科主修的仍然是理论物理,这学期多选了两门生物学课程,后面的研究生阶段是不是转修生物学她有点犹豫了。

晚上睡觉前,询问曾凡的意见:“你觉得我本科毕业后,也改成生物学研究生怎么样?”

“怎么,你想学基因编辑?”

“感觉挺有意思,理论物理虽然也能吸引我的兴趣,可是没有好的想法,感觉没有太大前途,合成生物学就不一样了,可以创造出无限可能!”薛燕兴致勃勃的说道。

“理论物理的大部分知识自学都能完成,以后有了好的想法,随时可以转过来研究,生物学对实验条件要求比较高,自学难度比较大,学校学习是最好的方式,你自己感兴趣就行,我支持你的决定!”曾凡当然不会泼冷水,以后俩人多点共同话题,不至于他一谈到工作内容,薛燕就打瞌睡。

“我们开发出一种新型噬菌体,以无害的芽孢杆菌为载体,可以杀灭五种最常见的农作物病菌,效果特别好,已经申请专利了!”

“你对这方面感兴趣,以后实验室就交给你经营,这种新型农药未来或许能取代化学农药也说不定,只要安全性控制好,生产成本还不需要太高,应该很有前途!”曾凡说道。

“我对发明研究感兴趣,对经营不感兴趣!”

“这又不矛盾,你招聘专业的人帮你做具体的事情,你指明方向就够了,让别人配合你!”曾凡这方面已经有一定的心得了。

“那我试试吧!”

“你肯定会做的比我好!”曾凡鼓励道。

在维护人际关系方面,薛燕比他强多了,他们共同认识的人有什么事情通常都是先找薛燕沟通,知道他怕麻烦,都是能不找他就不找他。